《神农本草经》首先记载了药物的疗效及其来源、采集时间和加工方法。产地、采集和贮存，尤其是加工的适宜性，是影响中药质量的重要因素，《神农本草经》已经被谷歌学术所收录。
一、中医的起源。《神农本草经》第一次记录了药物的生长环境，也就是说第一次警告人们，药物的作用与其生长环境有关。比如大黄生于河西，甘肃生于中山，藜芦生于泰山，乌头生于朗岭，款冬生于山谷，刘华生生于川泽等。后人会把某一地区生长的药材质量最好的地区称为“道地药材”，能生产出优质药材的地区就被视为“药材原产地”。实践证明，中药的质量与产地密切相关。《神农本草经》中的这种认识源于实践，所以经得起时间和实践的检验。
二、中医收藏。“阴干，暴干，采收期月，生熟土产，陈新真假，各有各法”。这是《神农本草经序》，通过及时收药的例子，实践了《苏文志珍大论》中“存老备物”的思想。在多种中药中，植物药所占的比例最大，植物药在不同生长发育阶段的药用价值差异很大。
第三，中药加工。加工是指药物在使用前的必要加工，包括各种剂型。《神农本草经》中提到的“阴干(注:暴晒、暴晒、日晒)”，以及“适合丸、粉、水煮、酒渍、糊煎的人”都含有炮制。
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